สำนักงานเศรษฐกิจการเกษตรที่ 1 มีภารกิจที่ต้องดำเนินงานภายใต้ขอบเขตภารกิจที่กำหนดไว้ในกฎกระทรวง และ พรบ.เศรษฐกิจการเกษตร พ.ศ. 2522 แบ่งโครงสร้างการบริหารงานภายในออกเป็น 3 ส่วน และ 1 ฝ่าย ประกอบด้วย ส่วนสารสนเทศการเกษตร ส่วนวิจัยและประเมินผล ส่วนแผนพัฒนาเขตเศรษฐกิจการเกษตร และฝ่ายบริหารงานทั่วไป ดังนี้
1) ฝ่ายบริหารงานทั่วไป มีหน้าที่รับผิดชอบ
1.1) งานสารบรรณ งานการเงินและบัญชี และงานพัสดุครุภัณฑ์ของ สศท.1
1.2) งานประสานในการจัดทำแผนงานและงบประมาณของ สศท.1 กับส่วนกลาง
1.3) งานประสานติดตามและรายงานผลการปฏิบัติงานและการใช้จ่ายเงินของ สศท.1 กับส่วนกลาง
2) ส่วนสารสนเทศการเกษตร มีหน้าที่ความรับผิดชอบ
2.1) งานวางแผนการสำรวจจัดเก็บรวบรวมข้อมูลปฐมภูมิเกี่ยวกับการผลิตสินค้าเกษตรในภาคสนามของพื้นที่ที่รับ
ผิดชอบและตรวจสอบความถูกต้องของข้อมูลเบื้องต้น
2.2) งานบันทึกและประมวลผลข้อมูล และวิเคราะห์ข้อมูลเกี่ยวกับการผลิตสินค้าเกษตรในระดับจังหวัด/อำเภอของพื้นที่รับผิดชอบ รวมทั้งรายงานผลการวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้นกลับส่วนกลาง
2.3) จัดทำรายงานผลข้อมูลขั้นสุดท้ายและเผยแพร่ข้อมูลสารสนเทศการเกษตรให้แก่หน่วยงานที่เกี่ยวข้อง และเกษตรกรในระดับพื้นที่ที่รับผิดชอบ
3) ส่วนแผนพัฒนาเขตเกษตรเศรษฐกิจ มีหน้ามี่ความรับผิดชอบ
3.1) ศึกษาวิเคราะห์ความเชื่อมโยงและความสอดคล้องของแผนพัฒนาเขตเศรษฐกิจการเกษตร ในระดับพื้นที่ให้สอดคล้องกับแผนพัฒนาการเกษตรและสหกรณ์ในระดับพื้นที่ที่รับผิดชอบ
3.2) ศึกษา วิเคราะห์ และรายงานภาวะเศรษฐกิจการเกษตร และคาดการณ์แนวโน้มในระดับพื้นที่ที่รับผิดชอบ
3.3) ศึกษา วิเคราะห์ และให้ข้อเสนอแนะในการจัดทำแผนปฏิบัติการด้านการเกษตรและสหกรณ์ จัดทำแผนโครงการแก่ส่วนราชการต่างๆ ในระดับพื้นที่
4) ส่วนวิจัยและประเมินผล มีหน้าที่ความรับผิดชอบ
4.1) ศึกษา วิเคราะห์ ติดตามและรายงานสถานการณ์การผลิต การตลาด และราคาสินค้าเกษตรที่เกษตรกรได้รับ
ในพื้นที่รวมทั้งรายงานข้อมูลกลับมายังส่วนกลาง
4.2) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัยเศรษฐกิจการเกษตร ภาวะเศรษฐกิจสังคมของครัวเรือนเกษตรใน พื้นที่ที่รับผิดชอบ
4.3) ติดตามและประเมินผล ความสำเร็จ และผลกระทบของการดำเนินงานตามมาตรการ แผนงานโครงการต่างๆ รวมทั้งรายงานผลการติดตาม ผลการประเมินและข้อเสนอแนะ แก่ส่วนราชการอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องในระดับพื้นที่ที่รับผิดชอบ